В соответствии с Федеральным законом от 29 декабря 2020 г. № 466-ФЗ "О территориальной юрисдикции гарнизонных военных судов" юрисдикция Запорожского гарнизонного военного суда распространяется на воинские части, учреждения Вооруженных Сил Российской Федерации, другие войска, воинские формирования и органы, дислоцируемые на территории Запорожской области.